Strumenti
| | MISEQ ILLUMINAPiattaforma di sequenziamento NGS che consente di generare sino a 25 milioni di sequenze lunghe da 25 a 300 nucleotidi in modalità paired end (PE 2X300). |
| | MinION ONTPiattaforma di sequenziamento portatile in grado di sfruttare la tecnologia del nanoporo in tempo reale. |
| | 3730xl GENETIC ANALYZERStrumento per l’elettroforesi capillare che consente sia l’analisi di marcatori molecolari classici (SSR, AFLP, RFLP) sia il sequenziamento SANGER. |
| | Illumina HiScan ReaderPiattaforma di genotipizzazione dedicata per l’analisi dei microarray BeadChip Illumina. |
| | Axiom GeneTitanPiattaforma di ultima generazione per l’analisi di espressione genica e di genotipizzazione in grado di processare gli array Affimetrix ad altissima densità. |
| | LIGHTCYCLER480 RT-PCRStrumento per l’analisi in tempo reale (RT) di geni target attraverso la reazione a catena della polimerasi (PCR), in grado di processare fino a 384 campioni contemporaneamente. |
| | ViiA7 RT-PCRStrumento per l’analisi RT-PCR di geni target mediante l’utilizzo della tecnologia TaqMan Array Cards. |
| | TapeStation 4150Strumento per l’elettroforesi capillare che consente l’analisi di frammenti di DNA/RNA per eseguire la separazione e la quantificazione di acidi nucleici. |
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Servizi
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| Preparazione dei campioni- Estrazione, purificazione e quantificazione degli Acidi Nucleici (DNA, RNA, plasmid)
- Estrazione del DNA ad alto peso molecolare (Nanopore Minion)
- Preparazione e quantificazione di librerie NGS (RNA-seq, Full Shotgun, Amplicon)
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| Sequenziamento - Sequenziamento SANGER (PCR, Plasmid, BAC sequencing)
- Next Generation Sequencing:
- full shotgun DNA genomico e ambientale
- trascrittomica e studi di espressione genica
- sequenziamento geni marker (16S, ITS, 18S, COI, trnL, rbcL)
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| Genotipizzazione - SSR Genotyping (MAB, MAS)
- SNP Genotyping (WGAS)
- Genotyping by sequencing (GBS)
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