FONDAZIONE EDMUND MACH - Centro Ricerca e Innovazione

(Horizon Europe MSCA Postdoctoral Fellowships 2022)  Questo progetto prevede di utilizzare un roditore modello (arvicola rossastra) e i recenti sviluppi nella tecnologia metatrascrittomica (MTX) per studiare l'impatto di microbiota dei suoli forestali e urbani sullo sviluppo e la funzione del microbiota intestinale (batteri e funghi) e sul sistema immunitario. Lo sviluppo del microbiota intestinale sarà seguito durante le fasi critiche di crescita delle arvicole giovani per comprendere meglio come l'esposizione a diversi microbi all'inizio della vita influenzi i) la diversità e composizione del microbiota (poiché i membri fondatori del microbiota influenzano pesantemente la composizione del microbiota per tutta la vita dell'ospite); ii) la sua funzione primaria come barriera (un microbiota naturale previene l'invasione di agenti patogeni) e iii) "addestramento" del sistema immunitario dell'ospite) (diverse componenti del microbiota influenzano le vie infiammatorie.

I campioni da utilizzare in questo progetto sono stati raccolti come parte di un esperimento di intervento sulla biodiversità recentemente completato condotto presso l'Università di Jyväskylä nel 2022.

Attività FEM:
Il postdoc Dr Toni Jernfors sarà ospitato nell'Unità di Ricerca CRI-GC dove applicherà la metatrascrittomica per studiare il funzionamento del microbiota intestinale utilizzando campioni di DNA e RNA già disponibili. Con i ricercatori e tecnologi dell'Unità, imparerà a preparare i library, ed a integrare e analizzare i dati metatassonomica e metatrascrittomica. In collaborazioni con questi colleghi preparerà manoscritti scientifici innovativi.