(HEU Horizon Europe) Preventing pandemics with biodiversity recovery. 
How important is nature restoration targeting biodiversity recovery? Can it also help prevent future disease (zoonotic and vector-borne) outbreaks? Despite the thousands of ongoing and planned nature restoration projects globally, little is known about whether these restorations indeed interrupt the infect-shed-spill-spread cascade and mitigate disease risk. In this context, the EU-funded BEPREP project will find answers and provide practical information. Taking a participatory approach, BEPREP will involve indigenous and local communities in the identification of success factors of best practice restorations and interventions. The aim is to assist the infect-shed-spill-spread cascade and prevent disease outbreaks. BEPREP’s findings will contribute to shaping a Europe that is prepared to respond to disease risk.

(MIUR PRIN) Obiettivi generali del progetto sono la comprensione e la modellizzazione di come la struttura e la composizione delle comunità di carnivori influenzano e sono influenzate dai parassiti che sono ospitati all'interno della stessa comunità animale. Lo scopo è di capire come i cambiamenti attesi in tali comunità (arrivo o estinzione di specie di carnivori), o l'introduzione o l'invasione naturale di nuovi parassiti (aspettato con il cambiamento climatico), possano impattare questa comunità di ospiti e parassiti (in termine di distribuzione, numero di individui), e la successiva diffusione di questi parassiti a livello nazionale e continentale.

Attività FEM:
FEM sarà responsabile per la genotipizzazione di campioni fecali dei canidi (lupo, sciacallo), e lo screening (tramite protocolli molecolari appropriati e ottimizzati) della comunità parasitologica contenuti in essi; l'allenamento e supervisione dell'assegnista; stesura di pubblicazioni scientifiche.

(AdPi) Predisporre una metodica uniforme per le analisi genetiche, allo scopo di consentire una descrizione transazionale della popolazione dei lupi della regione alpina. Sarà creato un database per garantire lo scambio dei dati relativi ai lupi genotipizzati, tra le diverse regioni ArgeAlp, come dettagliato nella resoluzione della COmunità di lavoro delle Regioni Alpine (ARGEALP) su tema della "Gestione transfrontaliera del lupo" adottata dalla 53a Conferenza dei Capi di Governo di ArgeAlp il 21 ottobre 2022 a Innsbruck.

ATTIVITA' FEM:
Ottimizzazione di un metodo di high throughput sequencing per la genotipizzazione dei campioni non-invasivi di lupo nelle regioni ArgeAlp Italia, in collaborazione con gli altri 3 laboratori incaricati dalle regioni ArgeAlp delle analisi dei campioni di lupo: Research Institute of Wildlife Ecology (Austria), Senkenburg Institute (Germania), e Univ. Lausanne (Svizzera). Parteciperà alla creazione di un database transnazionale per garantire lo scambio efficiente dei dati relativi ai lupi genotipizzati tra le diverse regioni di ArleAlp.

(Marie Skłodowska-Curie Actions MSCA) The current global biodiversity crisis requires rapid, inexpensive and reliable methods of detecting the main threats to species’ survival: pathogens, habitat change, and loss of genetic diversity1. Equally crucial are solutions for stemming biodiversity loss: we lack vital models that determine how these threats interact, which would help prioritise conservation efforts. Recently, CRI-CG has discovered for one species of frog over a relatively small geographic area that eDNA extracted from water samples captures more genetic diversity than analyses using tissue samples (UNESCO-funded project ACQUAVIVA). The same eDNA can be used to detect amphibian pathogens. NIPMAP will apply this knowledge in an innovative way by: i) optimizing this eDNA approach to estimate mtDNA diversity in four amphibian taxa (two caudates, two anurans) and pathogen diversity (principal pathogens: Bd, Bsal, Rv) across the eastern Italian Alps; ii) using these data to inform individual-based and spatially explicit simulations of host movements and pathogen transmission37; iii) integrating parameters from i-ii with skin microbiota and other health indices, as well as iv) environmental variables at each sample site, to generate correlative models (e.g. GLMMs and SDMs) and potential distribution maps to direct conservation management decisions. We will also pilot two innovative eDNA protocols: one to measure nuclear DNA diversity (to measure current gene flow and dispersal rates) and one to understand microbiota function using metatranscriptomics. These interdisciplinary tools will be integrated into a workflow that will be applicable to animal taxa anywhere on the planet.